Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ush1cQ9ES64 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms