Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube3bQ9ES34 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3bQ9ES34 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms