Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubiad1Q9DC60 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubiad1Q9DC60 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms