Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf6Q9DBU5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Rnf6Q9DBU5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf6Q9DBU5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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