Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms