Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms