Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms