Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc81Q9D5W4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms