Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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