Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1dQ9D4V4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms