Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc105Q9D4K7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc105Q9D4K7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc105Q9D4K7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc105Q9D4K7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms