Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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