Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mdm1Q9D067 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms