Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snf8Q9CZ28 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Snf8Q9CZ28 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snf8Q9CZ28 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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