Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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