Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms