Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms