Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ifitm3Q9CQW9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ifitm3Q9CQW9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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