Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccer1Q9CQL2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccer1Q9CQL2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccer1Q9CQL2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccer1Q9CQL2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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