Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms