Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms