Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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