Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl4bQ9CQ84 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl4bQ9CQ84 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms