Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms