Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms