Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms