Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ciao1Q99KN2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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