Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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SmagpQ99KC7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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SmagpQ99KC7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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SmagpQ99KC7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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SmagpQ99KC7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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SmagpQ99KC7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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SmagpQ99KC7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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SmagpQ99KC7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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