Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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