Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms