Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PdgfdQ925I7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms