Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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