Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms