Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms