Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps4aQ8VEJ9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms