Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms