Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3G9

Tspan8, Tetraspanin-8, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan8Q8R3G9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan8Q8R3G9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms