Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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