Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Impg1Q8R1W8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms