Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SbsnQ8CIT9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms