Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClasrpQ8CFC7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClasrpQ8CFC7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClasrpQ8CFC7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClasrpQ8CFC7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ClasrpQ8CFC7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClasrpQ8CFC7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClasrpQ8CFC7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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