Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh13Q8CEE7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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