Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms