Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm9949Q8C9F4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9949Q8C9F4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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