Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms