Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms