Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Liat1Q810M6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms