Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms