Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rexo1Q7TT28 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rexo1Q7TT28 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms