Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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